1 միավոր (U) Pfu ԴՆԹ պոլիմերազայի գործունեությունը սահմանվում է որպես ֆերմենտի քանակ, որը պահանջվում է 10 նմոլ դեօքսինուկլեոտիդներ թթվային չլուծվող նյութերի մեջ ներառել 74 ° C ջերմաստիճանում 30 րոպեի ընթացքում ՝ օգտագործելով սաղմոնի սերմնահեղուկի ակտիվացված ԴՆԹ-ն որպես կաղապար/նախաներկ:
SDS-PAGE- ի հայտնաբերմամբ մաքրությունը կազմում է ավելի քան 99%; Էկզոգեն նուկլեզի ակտիվություն չի հայտնաբերվում. Մարդու գենոմի մեկ կրկնօրինակի գենը կարող է արդյունավետ ուժեղացվել. Մեկ շաբաթվա ընթացքում սենյակային ջերմաստիճանում պահվելիս էական ակտիվություն չի փոխվում:
Այն ունի 3′-5 ′ էկզոնուկլազի և 5′-3 ′ էկզոնուկլազի ակտիվություն: ԴՆԹ-ի ուժեղացման երկարացման արագությունն ավելի ցածր է, քան Taq պոլիմերազայինը, և ընդհանրապես Pfu ֆերմենտի երկարացման արագությունը կազմում է 0.5-1 կբ / րոպե: Pfu- ի ջերմային կայունությունն ավելի լավ է, քան Taq- ը: GC- ի բարձր պարունակությամբ կաղապարների համար, դենատուրացիայի ջերմաստիճանը կարող է բարձրացվել մինչև 98 ° C, ինչը ոչ մի ազդեցություն չի ունենում Pfu պոլիմերազայի գործունեության վրա: ՊՇՌ արտադրանքը բութ ծայրով է, որը կարող է ավելացվել 3'-dA գերլարվածքով `նախքան TA վեկտորով կապելը կամ կլոնավորված բութ վեկտորով կլոնավորվելը:
Այն կարող է օգտագործվել ԴՆԹ-ի բարձր հավատարմության ուժեղացման համար, ինչպիսիք են գենի արտահայտման կլոնավորումը, տեղակայված մուտացիան, մեկ նուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմի (SNP) վերլուծությունը և վերջնական վերանորոգումը:
Բոլոր ապրանքները կարող են հարմարեցվել ODM/OEM- ի համար: Մանրամասների համար ՝սեղմեք Անհատականացված ծառայություն (ODM/OEM)
Օգտագործեք գենոմային ԴՆԹ -ն որպես կաղապար `1 կբ հատվածը մեծացնելու համար: PCR արձագանքից հետո վերցրեք 5 μl էլեկտրոֆորեզի հայտնաբերման համար: |
A-1 կաղապար
■ Կաղապարը պարունակում է սպիտակուցային խառնուրդներ կամ Taq ինհիբիտորներ և այլն: —— Մաքրել ԴՆԹ ձևանմուշը, հեռացնել սպիտակուցային կեղտերը կամ հանել մաքրման հավաքածուներով ԴՆԹ ձևանմուշը:
Temp Կաղապարի հետադարձումը լիարժեք չէ. —Համապատասխանաբար բարձրացնել դենատուրացիայի ջերմաստիճանը և երկարացնել Denaturation time- ը:
■ Կաղապարի դեգրադացիա —— Կրկին պատրաստեք կաղապարը:
A-2 այբբենարան
Prim Նախնական այբբենարանների վատ որակը.
■ Այբբենարանի քայքայումը —— բարձր կոնցենտրացիայի հիմքերը փոքր ծավալի բաժանեք պահպանման համար: Խուսափեք բազմակի սառեցումից և հալվելուց կամ երկարաժամկետ 4 ° C ջերմաստիճանի սառեցման պահպանումից:
Prim այբբենարանների ոչ պատշաճ ձևավորում (օր. Այբբենարանի երկարությունը բավարար չէ, հիմքը ձևավորվում է այբբենարանների միջև և այլն)
A-3 մգ2+համակենտրոնացում
Մգ2+ համակենտրոնացումը չափազանց ցածր է —— increaseիշտ բարձրացնել Mg– ն2+ համակենտրոնացում. օպտիմալացնել Mg- ը2+ կոնցենտրացիան մի շարք ռեակցիաներով `1 մմ -ից մինչև 3 մմ, 0.5 մմ միջակայքով` օպտիմալ Mg որոշելու համար2+ կոնցենտրացիան յուրաքանչյուր կաղապարի և այբբենարանի համար:
A-4 Կռման ջերմաստիճան
An Խտացման բարձր ջերմաստիճանը ազդում է այբբենարանի և կաղապարի կապման վրա: - Կրճատել կռացման ջերմաստիճանը և օպտիմալացնել վիճակը 2 ° C գրադիենտով:
A-5 Երկարացման ժամանակ
Extension Կարճաժամկետ երկարացում —— Բարձրացրեք երկարացման ժամանակը:
Երեւույթներ. Բացասական նմուշները ցույց են տալիս նաեւ թիրախային հաջորդականության գոտիները:
A-1 PCR- ի աղտոտում
Target Թիրախային հաջորդականության կամ ուժեղացման արտադրանքի խաչաձև աղտոտում. Ռեակտիվները կամ սարքավորումները պետք է ավտոկլավավորվեն `գոյություն ունեցող նուկլեինաթթուները վերացնելու համար, իսկ վարակման առկայությունը պետք է որոշվի բացասական հսկողության փորձերի միջոցով:
■ Ռեագենտով վարակվածություն.
A-2 Primer
Մգ2+ համակենտրոնացումը չափազանց ցածր է —— increaseիշտ բարձրացնել Mg– ն2+ համակենտրոնացում. օպտիմալացնել Mg- ը2+ կոնցենտրացիան մի շարք ռեակցիաներով `1 մմ -ից մինչև 3 մմ, 0.5 մմ միջակայքով` օպտիմալ Mg որոշելու համար2+ կոնցենտրացիան յուրաքանչյուր կաղապարի և այբբենարանի համար:
Prim Այբբենարանի ոչ պատշաճ ձևավորում, և թիրախային հաջորդականությունն ունի հոմոլոգիա ոչ նպատակային հաջորդականության հետ: —— Նախաստեղծ այբբենարաններ:
Ֆենոմեններ. PCR ուժեղացման գոտիները անհամապատասխան են սպասվող չափին ՝ մեծ կամ փոքր, երբեմն էլ լինում են ինչպես հատուկ ուժեղացման գոտիներ, այնպես էլ ոչ սպեցիֆիկ ուժեղացման գոտիներ:
A-1 այբբենարան
Prim Այբբենարանի վատ յուրահատկություն
—— Նոր դիզայնի այբբենարան:
■ Նախաներկի կոնցենտրացիան չափազանց բարձր է. —Roիշտ բարձրացնել դենատուրացիայի ջերմաստիճանը և երկարացնել դենատուրացիայի ժամանակը:
A-2 մգ2+ համակենտրոնացում
The Mg2+ կոնցենտրացիան չափազանց բարձր է —— reduceիշտ նվազեցնել Mg2+ կոնցենտրացիան2+ կոնցենտրացիան մի շարք ռեակցիաներով `1 մմ -ից մինչև 3 մմ, 0.5 մմ միջակայքով` օպտիմալ Mg որոշելու համար2+ կոնցենտրացիան յուրաքանչյուր կաղապարի և այբբենարանի համար:
A-3 rmերմակայուն պոլիմերազա
En Չափից մեծ ֆերմենտի քանակ - —Պակասեցրեք ֆերմենտի քանակը համապատասխանաբար 0.5 U ընդմիջումներով:
A-4 Կռման ջերմաստիճան
An Կռման ջերմաստիճանը չափազանց ցածր է .— increaseիշտ բարձրացնել կռացման ջերմաստիճանը կամ ընդունել երկաստիճան հովացման մեթոդը
A-5 PCR ցիկլեր
PC Չափից շատ PCR ցիկլեր —— Կրճատեք PCR ցիկլերի քանակը:
A-1 այբբենարան—————————––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––————————————————————————————————————————————————————————————————— -րագրի վերափոխում, փոխում այբբենարանի դիրքն ու երկարությունը ՝ դրա յուրահատկությունը բարձրացնելու համար. կամ կատարել ներկառուցված PCR:
A-2 Կաղապար ԴՆԹ
—— Կաղապարը մաքուր չէ —— Մաքրեք կաղապարը կամ հանեք ԴՆԹ – ն մաքրման հավաքածուներով:
A-3 մգ2+ համակենտրոնացում
—— Մգ2+ համակենտրոնացումը չափազանց բարձր է —— reduceիշտ նվազեցնել Mg– ն2+ համակենտրոնացում. օպտիմալացնել Mg- ը2+ կոնցենտրացիան մի շարք ռեակցիաներով `1 մմ -ից մինչև 3 մմ, 0.5 մմ միջակայքով` օպտիմալ Mg որոշելու համար2+ կոնցենտրացիան յուրաքանչյուր կաղապարի և այբբենարանի համար:
A-4 dNTP
—— dNTP– ների կոնցենտրացիան չափազանց բարձր է —— համապատասխանաբար նվազեցնել dNTP– ի կոնցենտրացիան
A-5 Կռման ջերմաստիճան
—— Շատ ցածր հալման ջերմաստիճան —— increaseիշտ բարձրացնել հալման ջերմաստիճանը
A-6 ցիկլեր
—— Չափից շատ ցիկլեր —— Օպտիմալացրեք ցիկլի համարը
Առաջին քայլը համապատասխան պոլիմերազի ընտրությունն է: Սովորական Taq պոլիմերազան չի կարող սրբագրել 3'-5 'էզոնուկլազի ակտիվության բացակայության պատճառով, և անհամապատասխանությունը մեծապես կնվազեցնի բեկորների երկարացման արդյունավետությունը: Հետևաբար, սովորական Taq պոլիմերազը չի կարող արդյունավետորեն ուժեղացնել 5 կբ -ից ավելի թիրախային բեկորները: Հատուկ փոփոխությամբ կամ բարձր հավատարմությամբ պոլիմերազով Taq պոլիմերազը պետք է ընտրվի երկարացման արդյունավետությունը բարձրացնելու և բեկորների երկարատև ուժեղացման կարիքները բավարարելու համար: Բացի այդ, երկար բեկորների ուժեղացումը պահանջում է նաև այբբենարանի դիզայնի համապատասխան ճշգրտում, դենատուրացիայի ժամանակ, երկարացման ժամանակ, բուֆերային pH և այլն: Կաղապարի վնասը կանխելու համար 94 ° C- ում դենատուրացիայի ժամանակը պետք է կրճատվի մինչև 30 վրկ կամ ավելի մեկ ցիկլով, իսկ ջերմաստիճանը մինչև 94 ° C բարձրացնելուց առաջ ՝ 1 րոպեից պակաս: Ավելին, երկարացման ջերմաստիճանը մոտ 68 ° C- ով սահմանելը և երկարացման ժամանակը նախագծելը `1 կբ/րոպե արագության համաձայն, կարող են ապահովել երկար բեկորների արդյունավետ ուժեղացում:
PCR- ի ուժեղացման սխալի մակարդակը կարող է նվազեցվել ՝ օգտագործելով բարձր հավատարմությամբ տարբեր ԴՆԹ պոլիմերազներ: Մինչ այժմ հայտնաբերված Taq ԴՆԹ -ի պոլիմերազներից Pfu ֆերմենտն ունի ամենացածր սխալի տոկոսադրույքը և ամենաբարձր հավատարմությունը (տես կցված աղյուսակը): Ֆերմենտի ընտրությունից բացի, հետազոտողները կարող են հետագայում նվազեցնել PCR մուտացիայի արագությունը `օպտիմալացնելով ռեակցիայի պայմանները, ներառյալ բուֆերային կազմի օպտիմալացումը, ջերմակայուն պոլիմերազի կոնցենտրացիան և PCR ցիկլի օպտիմալացումը:
Ստեղծման օրվանից մեր գործարանը մշակում է առաջին համաշխարհային կարգի արտադրանք ՝ պահպանելով սկզբունքը
որակի առաջին հերթին: Մեր արտադրանքը ձեռք է բերել գերազանց հեղինակություն արդյունաբերության մեջ և արժեքավոր վստահություն նոր և հին հաճախորդների շրջանում: